Почему у меня в комплекте идёт кабель с трех-контактным разъемом, а под капотом я нашел только двух-контактный подходящий разъем?

Вы нашли неправильный разъем. Нужный разъем должен иметь обязательно не меньше трех контактов. Часто на топливной рейке находятся два разъема — один из них двух-, а другой трех-контактный. Еще раз внимательно осмотрите топливную рейку и подсоедините кабель именно к трех-контактному разъему.